微波是一种高频电流，应用微波电流对疾病进行治疗和康复的方法称为“微波疗法”。与中波、短波及超短波一样，微波可以在人体内产生发热反应。但区别是，微波在人体内产生的热量分布更均匀，即使在人体深部的组织内，也可产生较强的发热反应。同时，微波疗法还有剂量准确，操作方便等优点。
患者在家庭中进行微波理疗时，只要操作正确，剂量在允许的范围内，不会对人体造成不良影响。但是如果在微波理疗时使用剂量过大，则会给患者造成一些不良反应，主要表现为体内组织温度升高和缺氧。这是由于大剂量的微波使人体内温度迅速上升，使组织的耗氧量明显升高，造成血液中血红蛋白与氧气的结合能力下降。同时，体内温度的上升使肺内血液流速加快，缩短了血液在肺内携氧及向组织内释放氧气的时间，使组织缺氧程度加剧，造成组织损伤。
但是，微波理疗方法在允许的剂量内应用是安全的，不会出现组织缺氧及损伤的情况，患者不用担心微波对人体的不良反应。个别患者在进行微波理疗时，偶尔可以观察到皮肤局部出现潮红及轻度肿胀，这是微波电疗造成的皮肤局部温度过高所致，不是微波本身造成的。