任何的药物都有其副作用，伟哥也不例外。目前已知较常见的副作用有头痛，通常于服药后1-4小时发生，约有16%的患者会出现；脸潮红，约有10%的患者会发生，这与使用伟哥后造成局部血管扩张有关；另外约有7%的患者会有消化不适现象；其他有鼻塞、腹泻、旋晕、皮疹；另外约有3%的患者会出现短暂性蓝绿色辨色异常的视觉障碍，这与视网膜视觉细胞内磷酸二酯酶受到抑制有关。
伟哥作为一种治疗勃起障碍的辅助药。它的治疗效果以心因性的勃起功能障碍效果比较好，可达70%左右的成功率。但是对于如糖尿病、脊髓伤害或高血脂症所引起的器质性的勃起功能障碍的疗效就差一些。而且，并不是所有的病人都可以尝试服用伟哥。对于年龄太大，身体虚弱或是肝、肾功能不好的患者必需降低剂量小心使用。更重要的是伟哥绝对不可以和硝化甘油类的药物一起服用，以免发生低血压，甚至休克的危险。