1.调整胃肠运动功能 芳香化湿药均含有挥发油，具有健胃驱风作用，故有刺激或调整胃肠运动功能的作用。佩兰、白豆寇能提高肠道紧张度，砂仁有促进肠管推进运动作用。另一方面，对乙酰胆碱、氯化钡等引起的动物离体肠肌痉挛，厚朴、苍术、砂仁等则有程度不等的解痉作用。芳香化湿药对胃肠运动的不同影响，与机体的机能状态有关，如苍术煎剂既能对抗乙酰胆碱所致小肠痉挛，又能对抗肾上腺素所致平滑肌抑制。此外，药物作用的不同与剂量也有一定关系，如厚朴煎剂对小鼠和豚鼠离体肠管，在小剂量下表现为兴奋，而大剂量则为抑制。
2.促进消化液分泌 厚朴、广霍香、自豆寇、草豆寇、草果等均含有挥发油，通过刺激嗅觉、味觉感受器，或温和地刺激局部黏膜，反射性地增加消化腺分泌。
3.抗溃疡 苍术、厚朴、砂仁等芳香化湿药，具有较强的抗溃疡作用。其主要作用环节包括：
①增强胃黏膜保护作用 从苍术中提取的氨基己糖具有促进胃黏膜修复作用。关苍术提取物还能增加氨基己糖在胃液和黏膜中的含量。
砂仁能促进胃黏膜细胞释放前列腺素，保护胃黏膜免遭许多外源性因素的损伤。
②抑制胃酸分泌过多厚朴酚能明显对抗四肽胃泌素及氨甲酰胆碱所致胃酸分泌增多，茅苍术所含β-桉叶醇有抗迅受体作用，能抑制胃酸分泌，并对抗皮质激素对胃酸分泌的刺激作用。
4.抗病原微生物 芳香化湿药具有不同程度的抗病原微生物作用。体外实验研究表明，厚朴酚、苍术提取物、广藿香酮对金黄色葡萄球菌、溶血性链球菌、肺炎球菌、百日咳杆菌、大肠杆菌、枯草杆菌、变形杆菌、痢疾杆菌、绿脓杆菌等具有抑制或杀灭作用。其中尤以厚朴抗菌力强，抗菌谱广。苍术对黄曲霉菌及其他致病性真菌，藿香的乙醚及乙醇浸出液对白色念珠菌、许兰氏黄癣菌、趾间及足跖毛癣菌等多种致病性真菌有抑制作用。厚朴、苍术、广藿香、砂仁、白豆寇对腮腺炎病毒、流感病毒等有抑制作用。
综上所述，与芳香化湿药疏畅气机、宣化湿浊、健脾醒胃等功效相关的药理作用为调整胃肠运动功能、促进消化液分泌、抗溃疡、抗病原微生物等。主要有效成分是所含挥发油。
本类药的药理作用多与所含挥发性成分有关，因此人药不宜久煎。