新生儿也有患沙眼性结膜炎的可能性，一般会在婴儿出生5-15天的样子出现明显症状，了解下沙眼性结膜炎的症状和治疗方法对防治新生儿沙眼性结膜炎很有必要。
新生儿沙眼衣原体结膜炎一般出现在生后5-14天发病，胎盘早破者的新生儿可在生后2天左右发病。该病的临床特点为眼睑结膜充血肿胀明显，并有大量分泌物流出（流泪），最初为浆液性分泌物，稀薄，以后转为脓性分泌物，粘稠。与淋病性结膜炎比较，新生儿沙眼衣原体结膜炎的预后比较好一些，一般不会侵犯角膜，也不会发生角膜穿孔，造成失明者极为罕见。且大多数自然病程较短，持续2-3周后充血肿胀减轻，分泌物显著减少，直至痊愈，很少会转为慢性和留有后遗症。
沙眼衣原体结膜炎是新生儿最为常见的结膜炎类型之一。因此，对于那些出生不久便出现眼睑红肿，流泪，特别是有大量脓性分泌物，以及眼睑结膜表面有伪膜形成时，必须及时做病原学检查，以尽快明确病因，了解是否为沙眼衣原体感染所致。